Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg10Q8R1P4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg10Q8R1P4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms