Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b4Q8QZY9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms