Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw1Q8K4P8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Hecw1Q8K4P8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Hecw1Q8K4P8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms