Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pof1bQ8K4L4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pof1bQ8K4L4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pof1bQ8K4L4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pof1bQ8K4L4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pof1bQ8K4L4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms