Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Rdh16f2Q8K3M1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Rdh16f2Q8K3M1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Rdh16f2Q8K3M1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rdh16f2Q8K3M1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rdh16f2Q8K3M1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rdh16f2Q8K3M1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Rdh16f2Q8K3M1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Rdh16f2Q8K3M1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh16f2Q8K3M1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Rdh16f2Q8K3M1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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