Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q2Q8K2Z8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q2Q8K2Z8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q2Q8K2Z8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q2Q8K2Z8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2q2Q8K2Z8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube2q2Q8K2Z8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube2q2Q8K2Z8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q2Q8K2Z8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2q2Q8K2Z8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms