Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700001C19RikQ8K168 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700001C19RikQ8K168 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700001C19RikQ8K168 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700001C19RikQ8K168 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700001C19RikQ8K168 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700001C19RikQ8K168 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms