Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfm1Q8K0D5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.7 ms