Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a8Q8JZR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc4a8Q8JZR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a8Q8JZR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms