Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PdgfcQ8CI19 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfcQ8CI19 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfcQ8CI19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfcQ8CI19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms