Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arhgap29Q8CGF1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap29Q8CGF1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap29Q8CGF1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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