Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CD60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CD60 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CD60 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CD60 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CD60 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CD60 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CD60 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CD60 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CD60 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CD60 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CD60 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CD60 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CD60 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CD60 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CD60 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CD60 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CD60 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CD60 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CD60 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CD60 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CD60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CD60 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CD60 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CD60 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CD60 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CD60 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CD60 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CD60 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CD60 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CD60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CD60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CD60 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CD60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q8CD60 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CD60 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CD60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CD60 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CD60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CD60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CD60 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CD60 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CD60 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CD60 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CD60 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CD60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CD60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CD60 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CD60 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CD60 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CD60 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CD60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CD60 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CD60 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CD60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CD60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CD60 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CD60 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CD60 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CD60 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CD60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CD60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CD60 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CD60 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CD60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CD60 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CD60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CD60 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CD60 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CD60 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CD60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CD60 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CD60 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CD60 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CD60 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CD60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CD60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CD60 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CD60 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CD60 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CD60 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CD60 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CD60 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CD60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms