Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb2Q8CC27 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb2Q8CC27 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms