Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dclre1bQ8C7W7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms