Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc60Q8C4J0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc60Q8C4J0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms