Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrd1Q8C0R9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrd1Q8C0R9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrd1Q8C0R9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms