Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc169Q8BXX9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc169Q8BXX9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms