Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVT7

4921511C20Rik, RIKEN cDNA 4921511C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921511C20RikQ8BVT7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921511C20RikQ8BVT7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921511C20RikQ8BVT7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921511C20RikQ8BVT7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms