Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc30Q8BVF4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms