Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUD0

Gpr4, G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr4Q8BUD0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr4Q8BUD0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpr4Q8BUD0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr4Q8BUD0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms