Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik4Q8BMF5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms