Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpa1Q8BLA8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpa1Q8BLA8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms