Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem39bQ810L4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem39bQ810L4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmem39bQ810L4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms