Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcph1Q7TT79 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms