Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc93Q7TQK5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc93Q7TQK5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc93Q7TQK5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms