Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ40

Zic5, Zinc finger protein ZIC 5, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic5Q7TQ40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zic5Q7TQ40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zic5Q7TQ40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic5Q7TQ40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic5Q7TQ40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic5Q7TQ40 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic5Q7TQ40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic5Q7TQ40 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zic5Q7TQ40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic5Q7TQ40 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic5Q7TQ40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms