Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim17Q7TPM3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim17Q7TPM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms