Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prrc2bQ7TPM1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Prrc2bQ7TPM1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms