Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TwistnbQ78WZ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms