Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snd1Q78PY7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms