Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd3eapQ76KJ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms