Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cxcl3Q6W5C0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcl3Q6W5C0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms