Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms