Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300ld3Q6SJQ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300ld3Q6SJQ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300ld3Q6SJQ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300ld3Q6SJQ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300ld3Q6SJQ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300ld3Q6SJQ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300ld3Q6SJQ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300ld3Q6SJQ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms