Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil2Q6R2P8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms