Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil2Q6R2P8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil2Q6R2P8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms