Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpc4Q6PHQ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpc4Q6PHQ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc4Q6PHQ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc4Q6PHQ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc4Q6PHQ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pabpc4Q6PHQ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pabpc4Q6PHQ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc4Q6PHQ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms