Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prrt3Q6PE13 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrt3Q6PE13 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms