Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc3bQ6PDC0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms