Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf2Q6P9P0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slf2Q6P9P0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slf2Q6P9P0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms