Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2d40Q6P8N9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms