Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nwd2Q6P5U7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nwd2Q6P5U7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nwd2Q6P5U7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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