Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn7Q6P5G6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ubxn7Q6P5G6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn7Q6P5G6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms