Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms