Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Frg2f1Q6P3A2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms