Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpbp1Q6NXH3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gpbp1Q6NXH3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms