Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr44Q6NVE8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Wdr44Q6NVE8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wdr44Q6NVE8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wdr44Q6NVE8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wdr44Q6NVE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wdr44Q6NVE8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wdr44Q6NVE8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wdr44Q6NVE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wdr44Q6NVE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms