Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bfsp2Q6NVD9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bfsp2Q6NVD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms