Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SphkapQ6NSW3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SphkapQ6NSW3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SphkapQ6NSW3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SphkapQ6NSW3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms