Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggnbp1Q6K1E7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ggnbp1Q6K1E7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms