Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn11Q6J756 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn11Q6J756 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms